Sporları sütte ve peynir altı suyunda öldürmek ve uzaklaştırmak için birçok yöntem kullanılmaktadır. Sporlar, dayanıklı olduklarından ve bazıları pastörizasyona, UV ve gama ışımasına, donmaya, kurumaya ve kimyasal bileşenlerle işlemeye karşı dirençli olduğundan, onlardan kurtulmak özellikle zordur. Bununla birlikte, bu yaklaşımlar ürünün kalitesini önemli ölçüde düşürmekte, enerji tüketmekte ve çevreyi olumsuz yönde etkilemektedir.
Bakterilerin ve sporların sayısını büyük ölçüde azaltmanın etkili ve çevre dostu bir yolu, log 6'ya kadar azalma sağlayan seramik mikrofiltrasyonun kullanılmasıdır. Bakteriler ve sporlar, ürün akışından bakteri enzimleri ve somatik hücreler ile birlikte uzaklaştırılır.